| 获奖名称 | 获奖等级 | 获奖时间 |
|---|---|---|
| 何梁何利基金科学与技术进步奖 | 2016 | |
| 北京市科学技术奖 | 三等奖 | 2015 |
| 中国科学院杰出科技成就奖 | 2014 | |
| 国家自然科学奖二等奖 | 二等奖 | 2013年 |
| 第三届郭沫若中国历史学奖三等奖 | 三等奖 | 2007 |
| 国家自然科学奖二等奖 | 二等奖 | 2007 |
| 国家科技进步二等奖 | 二等奖 | 2005 |
| 中科院杰出科技成就奖 | 2003 | |
| 中科院自然科学奖二等奖 | 二等奖 | 2001 |
| 国家自然科学奖二等奖 | 二等奖 | 2000 |
| 中国科学院自然科学奖一等奖 | 一等奖 | 1999 |
| 首届郭沫若中国历史学奖 | 二等奖 | 1999 |
| 中国科学院自然科学三等奖 | 三等奖 | 1998 |
| 中国科学院自然科学三等奖 | 三等奖 | 1998 |
| 中国科学院自然科学一等奖 | 一等奖 | 1996 |
